辉瑞疫苗和复必泰疫苗在作用机理上面并没有明显的区别，这两种疫苗都属于MRNA疫苗。主要的区别就是生产企业不同，辉瑞疫苗是由美国辉瑞公司生产的，而复必泰疫苗则是由上海复兴医药和德国的生物公司合作研发的。
mrna疫苗的主要的作用原理就是，疫苗会通过转基因的方式将病毒的DNA转录为mrna，然后在体外进行修饰，再传递到机体当中进行表达，这样就可以使机体产生蛋白抗原，进而就会使机体产生针对该抗原的免疫应答，从而达到增强免疫力的目的。
辉瑞和复必泰这两种疫苗不同的地方就是，辉瑞疫苗属于辉瑞公司独立研发产品，而复必泰则是合作研发产品。在用户的数量方面，辉瑞公司疫苗用户非常广泛，全球绝大多数国家和地区都可以使用辉瑞公司的疫苗。但是复必泰的限制则比较多，大陆地区没有上市，仅在港澳地区有使用。